Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpn3Q9D3W4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpn3Q9D3W4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms