Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pus10Q9D3U0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pus10Q9D3U0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms