Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4933436I01RikQ9D3T1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms