Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Fndc8Q9D2H8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc8Q9D2H8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms