Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pramef12Q9D2F1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pramef12Q9D2F1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms