Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Susd3Q9D176 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Susd3Q9D176 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms