Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl55Q9CZ83 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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