Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Snf8Q9CZ28 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms