Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prelid3bQ9CYY7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prelid3bQ9CYY7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms