Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Exo5Q9CXP9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Exo5Q9CXP9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms