Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Yif1bQ9CX30 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Yif1bQ9CX30 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms