Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930553M12RikQ9CUH1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms