Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Otud1Q9CUB6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms