Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Fcf1Q9CTH6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Fcf1Q9CTH6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Fcf1Q9CTH6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Fcf1Q9CTH6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fcf1Q9CTH6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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