Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atp13a2Q9CTG6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms