Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Dis3Q9CSH3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Dis3Q9CSH3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms