Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rwdd1Q9CQK7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rwdd1Q9CQK7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms