Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rdm1Q9CQK3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rdm1Q9CQK3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms