Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ergic3Q9CQE7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ergic3Q9CQE7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms