Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nipsnap3bQ9CQE1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nipsnap3bQ9CQE1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms