Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Atp6v0e1Q9CQD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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