Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pkp2Q9CQ73 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pkp2Q9CQ73 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms