Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rpa3Q9CQ71 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms