Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Atg3Q9CPX6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms