Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bhlhe41Q99PV5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms