Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rrbp1Q99PL5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrbp1Q99PL5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rrbp1Q99PL5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms