Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
GpnmbQ99P91 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GpnmbQ99P91 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms