Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms