Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ubqln4Q99NB8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubqln4Q99NB8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms