Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atoh8Q99NA2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atoh8Q99NA2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms