Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf17Q99MV7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf17Q99MV7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf17Q99MV7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms