Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PtprtQ99M80 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PtprtQ99M80 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
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