Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gdpd3Q99LY2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gdpd3Q99LY2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms