Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Abcf2Q99LE6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Abcf2Q99LE6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms