Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nmd3Q99L48 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms