Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TriobpQ99KW3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TriobpQ99KW3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms