Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE1

Me2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me2Q99KE1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Me2Q99KE1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms