Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm2Q91YD4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm2Q91YD4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms