Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms