Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snx9Q91VH2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Snx9Q91VH2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms