Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Capn8Q91VA3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms