Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dkk4Q8VEJ3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk4Q8VEJ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms