Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Thoc3Q8VE80 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms