Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smg8Q8VE18 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Smg8Q8VE18 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Smg8Q8VE18 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Smg8Q8VE18 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Smg8Q8VE18 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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