Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCK3

Tubg2, Tubulin gamma-2 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg2Q8VCK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubg2Q8VCK3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms