Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rapgef3Q8VCC8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rapgef3Q8VCC8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms