Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc12Q8R344 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc12Q8R344 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms