Protein–RNA interactions for Protein: Q8R268

Vmn1r212, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r212Q8R268 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r212Q8R268 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r212Q8R268 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms