Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hecw1Q8K4P8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hecw1Q8K4P8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms