Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Otud6bQ8K2H2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Otud6bQ8K2H2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms